Hygiènisation du fumier de cheval au cours du compostage

Les deux agents pathogènes choisis dans cette étude, Rhodococcus equi et les œufs de Parascaris equorum sont reconnues comme étant très résistants dans l'environnement. Ils sont présents dans le cycle oro-fécal du jeune cheval et jouent un rôle prépondérant dans la contamination des sols des exploitations équines.  Ces pathogènes peuvent rester infectieux pendant des années dans les pâtures et le fumier.

• Rhodococcus equi est une bactérie pathogène considérée comme une des causes majeures de mortalité des poulains de moins de 6 mois dans les élevages. L'infection a lieu lors de l'inhalation de bactéries en suspension dans l'air issues d'un sol contaminé par des fèces équins. R. equi est capable de survivre et de se multiplier dans le sol et le tractus gastro-intestinal.
• Parascaris equorum est un parasite digestif prépondérant chez le poulain avant ou après le sevrage provoquant une perte d'appétit, un jetage nasal et un poil piqué. La principale voix d'infection est l'ingestion d'oeufs embryonnés provenant de l'environnement (pâtures contaminées). Les vers adultes entraînent un retard de croissance et éventuellement des coliques et obstructions de l'intestin grêle. Les chevaux adultes sont généralement immunisés.

Durant le processus de compostage au champ, la montée en température est provoquée par l'activité microbienne du fumier.

Au cours de cette expérience, la survie de Rhodococcus equi et des œufs de Parascaris a été testée in vitro dans un milieu de culture humide à différentes températures  37, 45, 50, 55 et 60 °C durant 14 jours.

Survie de Rhodococcus equi

La viabilité de R. equi n’est pas altérée après 6 jours d’incubation à 37 °C (température contrôle) alors qu’à 45, 50, 55, et 60 °C la quantité de R. equi passe sous les seuils de détection après respectivement : 6, 3, 1 jour(s) et 8 h.

Effet des hautes températures sur la survie de Rhodococcus equi au cours du temps. (Hébert et al 2009)

Ainsi Rhodococcus equi est détruit en 6 jours à 45°C, en 3 jours à 50°C, en 24h à 55°C.

Survie de Parascaris equorum

L'évolution de la viabilité des œufs de P. equorum au cours du temps est comparable à la suite d’une incubation à 45 et à 50 °C.  Par contre, à 55 et 60 °C, il faut moins de 2 h pour atteindre une réduction totale du nombre d'oeufs.

Effet des hautes températures sur la viabilité des œufs de P. equorum au cours du temps. (Hébert et al 2009)

Ainsi les œufs de Parascaris sont détruits  en 24 h à 45 ou 50 °C, en 2 heures à 55 ou 60°C.

En pratique :

Pour éviter la contamination des pâtures, il est important d’appliquer de bonnes pratiques de compostage et de ne pas sous-estimer les températures à atteindre lors des processus d’inactivation thermique.

Ainsi la mesure de la température de l'andain à l'aide d'une sonde thermique insérée au coeur de l'andain après passage de la composteuse (les quelques jours suivants) est indispensable pour contrôler l'assainissement de la matière.

Une température au coeur de l'andain atteignant au moins 45°C pendant 6 jours consécutifs permet de détruire Rhodococcus equi et Parascaris equorum et donc l'obtention d'un compost biologiquement assaini.
 
Plusieurs retournements des andains sont indispensables pour que toute la matière soit traitée à des températures hautes d'au moins 45°C.